Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HP1BP3Q5SSJ5 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HP1BP3Q5SSJ5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms