Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF628Q5EBL2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF628Q5EBL2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF628Q5EBL2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF628Q5EBL2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF628Q5EBL2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF628Q5EBL2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF628Q5EBL2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF628Q5EBL2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF628Q5EBL2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF628Q5EBL2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF628Q5EBL2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF628Q5EBL2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF628Q5EBL2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF628Q5EBL2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF628Q5EBL2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF628Q5EBL2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF628Q5EBL2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF628Q5EBL2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF628Q5EBL2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF628Q5EBL2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF628Q5EBL2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF628Q5EBL2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF628Q5EBL2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF628Q5EBL2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF628Q5EBL2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF628Q5EBL2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF628Q5EBL2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF628Q5EBL2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF628Q5EBL2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF628Q5EBL2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF628Q5EBL2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF628Q5EBL2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF628Q5EBL2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF628Q5EBL2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF628Q5EBL2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF628Q5EBL2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF628Q5EBL2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF628Q5EBL2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF628Q5EBL2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF628Q5EBL2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF628Q5EBL2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF628Q5EBL2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF628Q5EBL2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF628Q5EBL2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF628Q5EBL2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF628Q5EBL2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF628Q5EBL2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF628Q5EBL2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF628Q5EBL2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF628Q5EBL2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms