Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms