Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms