Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q499Y3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q499Y3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q499Y3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q499Y3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q499Y3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q499Y3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Q499Y3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q499Y3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q499Y3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q499Y3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q499Y3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q499Y3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q499Y3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q499Y3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q499Y3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q499Y3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q499Y3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q499Y3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q499Y3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q499Y3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q499Y3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q499Y3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q499Y3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q499Y3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q499Y3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q499Y3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q499Y3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q499Y3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q499Y3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q499Y3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q499Y3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q499Y3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q499Y3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q499Y3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q499Y3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q499Y3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q499Y3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q499Y3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q499Y3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q499Y3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q499Y3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q499Y3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q499Y3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q499Y3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q499Y3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q499Y3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q499Y3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q499Y3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q499Y3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q499Y3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q499Y3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q499Y3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q499Y3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q499Y3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q499Y3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q499Y3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q499Y3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q499Y3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q499Y3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q499Y3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q499Y3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q499Y3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q499Y3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Q499Y3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q499Y3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q499Y3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q499Y3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q499Y3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q499Y3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q499Y3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q499Y3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q499Y3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q499Y3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q499Y3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q499Y3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q499Y3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q499Y3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q499Y3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q499Y3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q499Y3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q499Y3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q499Y3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q499Y3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q499Y3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q499Y3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q499Y3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q499Y3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q499Y3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q499Y3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q499Y3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Q499Y3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Q499Y3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q499Y3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q499Y3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q499Y3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Q499Y3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q499Y3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q499Y3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q499Y3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms