Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LONRF3Q496Y0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms