Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EDRF1Q3B7T1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDRF1Q3B7T1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms