Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms