Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MICAQ29983 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MICAQ29983 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MICAQ29983 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MICAQ29983 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MICAQ29983 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MICAQ29983 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MICAQ29983 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MICAQ29983 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MICAQ29983 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MICAQ29983 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MICAQ29983 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MICAQ29983 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MICAQ29983 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MICAQ29983 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MICAQ29983 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MICAQ29983 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MICAQ29983 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MICAQ29983 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MICAQ29983 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MICAQ29983 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MICAQ29983 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MICAQ29983 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MICAQ29983 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MICAQ29983 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MICAQ29983 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MICAQ29983 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
MICAQ29983 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MICAQ29983 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MICAQ29983 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MICAQ29983 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MICAQ29983 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MICAQ29983 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MICAQ29983 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MICAQ29983 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MICAQ29983 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MICAQ29983 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MICAQ29983 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MICAQ29983 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MICAQ29983 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MICAQ29983 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MICAQ29983 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MICAQ29983 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MICAQ29983 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MICAQ29983 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MICAQ29983 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MICAQ29983 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MICAQ29983 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MICAQ29983 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MICAQ29983 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MICAQ29983 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MICAQ29983 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MICAQ29983 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MICAQ29983 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MICAQ29983 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MICAQ29983 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MICAQ29983 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MICAQ29983 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MICAQ29983 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MICAQ29983 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MICAQ29983 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MICAQ29983 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MICAQ29983 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MICAQ29983 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MICAQ29983 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MICAQ29983 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MICAQ29983 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MICAQ29983 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MICAQ29983 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MICAQ29983 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MICAQ29983 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MICAQ29983 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MICAQ29983 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MICAQ29983 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MICAQ29983 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MICAQ29983 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MICAQ29983 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MICAQ29983 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MICAQ29983 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MICAQ29983 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MICAQ29983 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MICAQ29983 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MICAQ29983 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MICAQ29983 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MICAQ29983 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MICAQ29983 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MICAQ29983 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MICAQ29983 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MICAQ29983 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MICAQ29983 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MICAQ29983 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MICAQ29983 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MICAQ29983 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MICAQ29983 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MICAQ29983 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MICAQ29983 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MICAQ29983 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MICAQ29983 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MICAQ29983 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MICAQ29983 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms