Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms