Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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CCDC142Q17RM4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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CCDC142Q17RM4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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CCDC142Q17RM4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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CCDC142Q17RM4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
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