Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms