Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
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SGCAQ16586 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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SGCAQ16586 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
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