Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCBQ16585 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
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