Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP6AP1Q15904 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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