Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
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NCOA1Q15788 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NCOA1Q15788 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NCOA1Q15788 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NCOA1Q15788 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NCOA1Q15788 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NCOA1Q15788 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NCOA1Q15788 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NCOA1Q15788 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NCOA1Q15788 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NCOA1Q15788 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NCOA1Q15788 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
NCOA1Q15788 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NCOA1Q15788 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
NCOA1Q15788 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NCOA1Q15788 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NCOA1Q15788 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
NCOA1Q15788 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NCOA1Q15788 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NCOA1Q15788 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NCOA1Q15788 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NCOA1Q15788 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NCOA1Q15788 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NCOA1Q15788 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
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