Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms