Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms