Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NWD1Q149M9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NWD1Q149M9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NWD1Q149M9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NWD1Q149M9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NWD1Q149M9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NWD1Q149M9 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NWD1Q149M9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NWD1Q149M9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NWD1Q149M9 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NWD1Q149M9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NWD1Q149M9 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NWD1Q149M9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NWD1Q149M9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NWD1Q149M9 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NWD1Q149M9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NWD1Q149M9 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NWD1Q149M9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NWD1Q149M9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
NWD1Q149M9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NWD1Q149M9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NWD1Q149M9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
NWD1Q149M9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NWD1Q149M9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NWD1Q149M9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NWD1Q149M9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NWD1Q149M9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NWD1Q149M9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NWD1Q149M9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NWD1Q149M9 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NWD1Q149M9 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
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