Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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RAB39AQ14964 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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RAB39AQ14964 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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RAB39AQ14964 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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RAB39AQ14964 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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