Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
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