Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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