Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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