Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
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