Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MTMR3Q13615 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
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