Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms