Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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