Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PMS2P3Q13401 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PMS2P3Q13401 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PMS2P3Q13401 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PMS2P3Q13401 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PMS2P3Q13401 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PMS2P3Q13401 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PMS2P3Q13401 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PMS2P3Q13401 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PMS2P3Q13401 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PMS2P3Q13401 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PMS2P3Q13401 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PMS2P3Q13401 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PMS2P3Q13401 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PMS2P3Q13401 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PMS2P3Q13401 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PMS2P3Q13401 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PMS2P3Q13401 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PMS2P3Q13401 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PMS2P3Q13401 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PMS2P3Q13401 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PMS2P3Q13401 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PMS2P3Q13401 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PMS2P3Q13401 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PMS2P3Q13401 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PMS2P3Q13401 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PMS2P3Q13401 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PMS2P3Q13401 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PMS2P3Q13401 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PMS2P3Q13401 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PMS2P3Q13401 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PMS2P3Q13401 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PMS2P3Q13401 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PMS2P3Q13401 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PMS2P3Q13401 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PMS2P3Q13401 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PMS2P3Q13401 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PMS2P3Q13401 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PMS2P3Q13401 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PMS2P3Q13401 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PMS2P3Q13401 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PMS2P3Q13401 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PMS2P3Q13401 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PMS2P3Q13401 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PMS2P3Q13401 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PMS2P3Q13401 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PMS2P3Q13401 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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