Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATMQ13315 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATMQ13315 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATMQ13315 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATMQ13315 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATMQ13315 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATMQ13315 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATMQ13315 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATMQ13315 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATMQ13315 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATMQ13315 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATMQ13315 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATMQ13315 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATMQ13315 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATMQ13315 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATMQ13315 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATMQ13315 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATMQ13315 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATMQ13315 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATMQ13315 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATMQ13315 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATMQ13315 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATMQ13315 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATMQ13315 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATMQ13315 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATMQ13315 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATMQ13315 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATMQ13315 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATMQ13315 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATMQ13315 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATMQ13315 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATMQ13315 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATMQ13315 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATMQ13315 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATMQ13315 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATMQ13315 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATMQ13315 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATMQ13315 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATMQ13315 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATMQ13315 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATMQ13315 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATMQ13315 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATMQ13315 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATMQ13315 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATMQ13315 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATMQ13315 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATMQ13315 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATMQ13315 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATMQ13315 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATMQ13315 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATMQ13315 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATMQ13315 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATMQ13315 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATMQ13315 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATMQ13315 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATMQ13315 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATMQ13315 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATMQ13315 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATMQ13315 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATMQ13315 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATMQ13315 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATMQ13315 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATMQ13315 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATMQ13315 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATMQ13315 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATMQ13315 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATMQ13315 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATMQ13315 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATMQ13315 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATMQ13315 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATMQ13315 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATMQ13315 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATMQ13315 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATMQ13315 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATMQ13315 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATMQ13315 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATMQ13315 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATMQ13315 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATMQ13315 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATMQ13315 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATMQ13315 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATMQ13315 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATMQ13315 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATMQ13315 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATMQ13315 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATMQ13315 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATMQ13315 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATMQ13315 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATMQ13315 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATMQ13315 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATMQ13315 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATMQ13315 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATMQ13315 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATMQ13315 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATMQ13315 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATMQ13315 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATMQ13315 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATMQ13315 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATMQ13315 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATMQ13315 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
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