Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
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