Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms