Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms