Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
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