Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SREBF2Q12772 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
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