Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCAPQ12770 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCAPQ12770 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCAPQ12770 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCAPQ12770 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCAPQ12770 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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