Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms