Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms