Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4DQ08499 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms