Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms