Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DEUP1Q05D60 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms