Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
EMX1Q04741 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EMX1Q04741 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms