Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUCB1Q02818 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms