Protein–RNA interactions for Protein: Q02539

HIST1H1A, Histone H1.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST1H1AQ02539 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIST1H1AQ02539 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms