Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OC90Q02509 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OC90Q02509 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OC90Q02509 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OC90Q02509 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OC90Q02509 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OC90Q02509 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OC90Q02509 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OC90Q02509 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OC90Q02509 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OC90Q02509 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OC90Q02509 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OC90Q02509 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OC90Q02509 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OC90Q02509 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OC90Q02509 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OC90Q02509 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OC90Q02509 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OC90Q02509 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OC90Q02509 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OC90Q02509 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OC90Q02509 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OC90Q02509 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
OC90Q02509 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OC90Q02509 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OC90Q02509 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OC90Q02509 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OC90Q02509 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OC90Q02509 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OC90Q02509 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OC90Q02509 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OC90Q02509 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OC90Q02509 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OC90Q02509 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OC90Q02509 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OC90Q02509 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OC90Q02509 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OC90Q02509 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OC90Q02509 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
OC90Q02509 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OC90Q02509 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OC90Q02509 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OC90Q02509 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OC90Q02509 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OC90Q02509 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OC90Q02509 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OC90Q02509 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OC90Q02509 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OC90Q02509 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
OC90Q02509 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OC90Q02509 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OC90Q02509 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OC90Q02509 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OC90Q02509 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OC90Q02509 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OC90Q02509 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OC90Q02509 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OC90Q02509 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OC90Q02509 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OC90Q02509 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OC90Q02509 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OC90Q02509 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OC90Q02509 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OC90Q02509 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OC90Q02509 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OC90Q02509 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OC90Q02509 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OC90Q02509 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OC90Q02509 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OC90Q02509 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OC90Q02509 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OC90Q02509 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OC90Q02509 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OC90Q02509 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OC90Q02509 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OC90Q02509 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
OC90Q02509 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OC90Q02509 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OC90Q02509 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
OC90Q02509 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
OC90Q02509 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OC90Q02509 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OC90Q02509 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OC90Q02509 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OC90Q02509 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OC90Q02509 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OC90Q02509 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OC90Q02509 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OC90Q02509 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OC90Q02509 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OC90Q02509 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OC90Q02509 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OC90Q02509 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OC90Q02509 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OC90Q02509 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OC90Q02509 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OC90Q02509 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OC90Q02509 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OC90Q02509 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OC90Q02509 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms