Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms