Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BNC1Q01954 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms