Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
OTUD4Q01804 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
OTUD4Q01804 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms