Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1BQ00975 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms