Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSG4Q00888 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSG4Q00888 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSG4Q00888 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSG4Q00888 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSG4Q00888 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSG4Q00888 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSG4Q00888 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSG4Q00888 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSG4Q00888 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSG4Q00888 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSG4Q00888 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSG4Q00888 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSG4Q00888 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSG4Q00888 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSG4Q00888 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSG4Q00888 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSG4Q00888 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSG4Q00888 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSG4Q00888 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSG4Q00888 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSG4Q00888 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms