Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms